Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smarcad1Q04692 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms