Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

Predictions only

Length 2,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Nf1Q04690 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms