Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CkbQ04447 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CkbQ04447 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CkbQ04447 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CkbQ04447 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms