Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Snai1Q02085 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Snai1Q02085 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms