Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ascl1Q02067 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms