Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sec23aQ01405 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms