Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HmgcrQ01237 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms