Protein–RNA interactions for Protein: Q01102

Selp, P-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelpQ01102 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SelpQ01102 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms