Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Grin2bQ01097 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Grin2bQ01097 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms