Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Itga4Q00651 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms