Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gfra1P97785 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gfra1P97785 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms