Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Bop1P97452 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms