Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Lig3P97386 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms