Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SgcgP82348 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
SgcgP82348 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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