Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smad1P70340 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Smad1P70340 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms