Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gfi1P70338 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gfi1P70338 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms