Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cux2P70298 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux2P70298 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms