Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Vamp7P70280 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms