Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Rpl18aP62717 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms