Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp46P62069 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp46P62069 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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