Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Lmo4P61969 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms