Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

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Length 85 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ufm1P61961 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms