Protein–RNA interactions for Protein: P61750

Arf4, ADP-ribosylation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf4P61750 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf4P61750 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Arf4P61750 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arf4P61750 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf4P61750 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arf4P61750 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms