Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Siah1aP61092 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Siah1aP61092 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms