Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snap25P60879 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Snap25P60879 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms