Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hps5P59438 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Hps5P59438 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms