Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CgnP59242 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CgnP59242 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CgnP59242 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CgnP59242 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CgnP59242 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CgnP59242 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CgnP59242 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CgnP59242 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CgnP59242 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CgnP59242 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CgnP59242 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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