Protein–RNA interactions for Protein: P59054

Csrnp1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp1P59054 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Csrnp1P59054 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Csrnp1P59054 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms