Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd4P58467 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd4P58467 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd4P58467 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd4P58467 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Setd4P58467 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms