Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dpf3P58269 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dpf3P58269 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dpf3P58269 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dpf3P58269 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dpf3P58269 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dpf3P58269 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dpf3P58269 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dpf3P58269 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dpf3P58269 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dpf3P58269 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dpf3P58269 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms