Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CtnsP57757 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CtnsP57757 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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