Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bace1P56818 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bace1P56818 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms