Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrp1P56183 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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