Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ephb3P54754 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ephb3P54754 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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