Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacnb3P54285 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms