Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
PctpP53808 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PctpP53808 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
PctpP53808 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms