Protein–RNA interactions for Protein: P51944

Ccnf, Cyclin-F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnfP51944 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
CcnfP51944 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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