Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VegfbP49766 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms