Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CitP49025 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CitP49025 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CitP49025 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CitP49025 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CitP49025 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CitP49025 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms