Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VdrP48281 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VdrP48281 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
VdrP48281 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
VdrP48281 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms