Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tulp2P46686 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tulp2P46686 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms