Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cdkn1bP46414 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms