Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
ItgavP43406 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
ItgavP43406 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms