Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
PtgfrP43117 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms