Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rab20P35295 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rab20P35295 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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