Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
OatP29758 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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OatP29758 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
OatP29758 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
OatP29758 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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