Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtprmP28828 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtprmP28828 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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