Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Slc6a9P28571 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms