Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Defa2P28309 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms