Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CebpbP28033 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms